İlahiyat Fakültesi Bakanlar Kurulu kararının 23 Haziran 2012 tarih ve 28332 sayılı Resmi Gazetede yayımlanmasıyla kurulmuştur.
2547 sayılı Yükseköğretim Kanunu’nun 16. maddesinin (a) fıkrası gereğince, İlahiyat Fakültesi Dekanlığı görevine 28 Eylül 2012 tarih ve 2012/36 sayılı Başkanlık kararı ile Prof. Dr. Bilal KEMİKLİ atanmıştır. 

2015 yılında Prof. Dr. Bilal KEMİKLİ'nin görevini tamamlamasının ardından Prof. Dr. Halis AYDEMİR dekan vekili olarak atanmıştır. 2016 yılında fakültemizin ismi İslami İlimler Fakültesi olarak değiştirilmiş ve 2017 yılında fakültemiz kendi binasına taşınmıştır.

2020 yılında Prof. Dr. Halis AYDEMİR'in görevini tamamlamasının ardından Prof. Dr. Ali ÇELİK dekan olarak atanmıştır. 21 Şubat 2024 tarihinde görevini tamamlayarak emekliğe ayrılan Prof. Dr. Ali ÇELİK'in yerine üniversitemiz Rektörü Prof. Dr. Süleyman KIZILTOPRAK dekan vekili olarak atanmıştır.

T.C. Cumhurbaşkanlığı tarafından yayımlanan 2 Ağustos 2024 tarihli ve 32620 sayılı Resmî Gazete'deki 8785 sayılı kararın III sayılı ekinde yer alan hüküm uyarınca, fakültemizin adı İlahiyat Fakültesi olarak değiştirilmiştir.

Üniversitemiz Rektörü Prof. Dr. Süleyman Kızıltoprak vekaleten sürdürdüğü fakültemizin dekanlık görevine Yüksek Öğretim Kurulu’nun tensipleriyle 28.08.2024 tarihinde Prof. Dr. İsmail Yalçın atanmıştır.